Die Studie wurde in den Ländern Ghana, Kenia und Malawi in insgesamt 158 einzelnen Gebieten durchgeführt. Diese Gebiete wurden nach dem Zufallsprinzip eingeteilt in die Untersuchungsgruppe, in der der Malaria-Impfstoff RTS,S/AS01E zum Standard-Impfangebot für Kleinkinder gehörte, und eine Vergleichsgruppe, in der dies nicht der Fall war. Die Malaria-Impfungen wurden – auf freiwilliger Basis – bei Kindern in Ghana und Kenia im Alter von sechs, sieben, neun und 24 Monaten durchgeführt, bei Kindern in Malawi im Alter von fünf, sechs, sieben und 22 Monaten.