Obwohl es eine gut verträgliche Impfung mit hoher Schutzrate gibt, werden in Österreich jährlich zwischen 100 und 200 FSME-Fälle registriert. Etwa jede zweite erwachsene betroffene Person weist bei der Entlassung aus dem Spital bleibende Einschränkungen auf. Rund zehn Prozent erleiden vorübergehende Lähmungen, die Sterblichkeit liegt bei etwa einem Prozent.