Un mod\u00e8le d’apprentissage automatique analysant la m\u00e9thylation de l’ADN bas\u00e9e sur CpG a pr\u00e9dit avec pr\u00e9cision l’origine de nombreux types de cancer diff\u00e9rents chez les patients atteints de cancers primaires inconnus (CUP), selon une recherche pr\u00e9sent\u00e9e lors de la r\u00e9union annuelle 2026 de l’American Association for Cancer Research (AACR), qui s’est tenue du 17 au 22 avril.<\/p>\n
Les CUP sont des tumeurs malignes m\u00e9tastatiques dans lesquelles le site primaire du cancer n’a pas pu \u00eatre identifi\u00e9. Ces cancers sont souvent associ\u00e9s \u00e0 de moins bons r\u00e9sultats, en partie parce que les d\u00e9cisions de traitement doivent \u00eatre prises sans conna\u00eetre l’origine du cancer, et que les patients sont g\u00e9n\u00e9ralement trait\u00e9s avec des sch\u00e9mas de chimioth\u00e9rapie larges et non sp\u00e9cifiques plut\u00f4t que des th\u00e9rapies cibl\u00e9es sur un type de cancer sp\u00e9cifique, selon le pr\u00e9sentateur Marco A. De Velasco, PhD, membre du corps professoral du D\u00e9partement de biologie du g\u00e9nome de l’Universit\u00e9 Kindai au Japon.<\/p>\n
\u00ab\u00a0Seulement entre 15 et 20 % des patients atteints de CUP pr\u00e9sentent des caract\u00e9ristiques qui permettent aux m\u00e9decins de les traiter avec des th\u00e9rapies sp\u00e9cifiques au site, associ\u00e9es \u00e0 de meilleurs r\u00e9sultats\u00a0\u00bb, a expliqu\u00e9 De Velasco.<\/p>\n
Cependant, la plupart des patients, entre 80 % et 85 %, re\u00e7oivent une chimioth\u00e9rapie plus g\u00e9n\u00e9rale, souvent moins efficace. Les patients recevant une th\u00e9rapie dirig\u00e9e sur site peuvent survivre jusqu’\u00e0 24 mois, contre six \u00e0 neuf mois pour ceux recevant un traitement standard. \u00bb<\/p>\n
Marco A. De Velasco, D\u00e9partement de biologie du g\u00e9nome, Universit\u00e9 Kindai<\/p>\n
Les chercheurs ont explor\u00e9 si l’identification de l’origine du cancer \u00e0 l’aide du profilage mol\u00e9culaire pourrait am\u00e9liorer les d\u00e9cisions de traitement. Ces approches analysent les mod\u00e8les de biologie tumorale, tels que l\u2019activit\u00e9 des g\u00e8nes ou les modifications chimiques de l\u2019ADN, qui diff\u00e8rent selon les types de cancer et peuvent persister m\u00eame apr\u00e8s la propagation du cancer. Bien que certaines m\u00e9thodes se soient r\u00e9v\u00e9l\u00e9es prometteuses, elles n\u2019ont pas d\u00e9montr\u00e9 de b\u00e9n\u00e9fices \u00e9vidents en termes de survie dans les essais cliniques, selon De Velasco.<\/p>\n
Dans cette \u00e9tude, De Velasco et ses coll\u00e8gues, dont le chercheur principal Kazuko Sakai, PhD, et le chercheur principal Kazuto Nishio, MD, PhD, ont d\u00e9velopp\u00e9 une nouvelle approche ax\u00e9e sur la m\u00e9thylation de l’ADN CpG, un type de modification chimique qui se produit au niveau des bases de l’ADN cytosine et guanine. De Velasco a not\u00e9 que la m\u00e9thylation CpG agit comme une \u00ab empreinte digitale \u00bb mol\u00e9culaire pour diff\u00e9rents tissus du corps. En analysant ces mod\u00e8les dans des \u00e9chantillons de tumeurs, les chercheurs ont d\u00e9velopp\u00e9 un mod\u00e8le informatique capable de distinguer 21 types de cancer diff\u00e9rents.<\/p>\n
\u00ab\u00a0Au lieu de nous appuyer sur des ensembles de donn\u00e9es volumineux et complexes, nous avons cherch\u00e9 \u00e0 identifier un ensemble de marqueurs plus petit et plus pratique, tout en conservant un fort pouvoir pr\u00e9dictif\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 De Velasco. \u00ab\u00a0L’objectif \u00e0 long terme est de cr\u00e9er un outil qui pourrait aider les m\u00e9decins \u00e0 identifier le tissu d’origine probable et \u00e0 \u00e9clairer des d\u00e9cisions de traitement plus efficaces.\u00a0\u00bb<\/p>\n
Le mod\u00e8le a \u00e9t\u00e9 d\u00e9velopp\u00e9 \u00e0 l\u2019aide des donn\u00e9es de m\u00e9thylation de pr\u00e8s de 7\u00a0500 patients atteints de 21 types de cancer diff\u00e9rents obtenues du programme Cancer Genome Atlas et d\u2019autres ensembles de donn\u00e9es publics. Les donn\u00e9es ont \u00e9t\u00e9 r\u00e9parties entre les cohortes de formation et de test.<\/p>\n
Les chercheurs ont appliqu\u00e9 l\u2019apprentissage automatique pour identifier les sites de m\u00e9thylation du CpG dans l\u2019ADN tumoral de la cohorte d\u2019entra\u00eenement et cr\u00e9er des profils de m\u00e9thylation associ\u00e9s \u00e0 diff\u00e9rents types de tumeurs.<\/p>\n
Les r\u00e9sultats de l’\u00e9tude ont montr\u00e9 que le mod\u00e8le a correctement identifi\u00e9 le type de cancer dans environ 95 % des cas dans la cohorte test\u00e9e et a maintenu de solides performances \u2013 une pr\u00e9cision d’environ 87 % \u2013 lorsqu’il est appliqu\u00e9 \u00e0 une cohorte de validation ind\u00e9pendante de l’institution du chercheur de 31 cas repr\u00e9sentant 17 types de cancer diff\u00e9rents.<\/p>\n
\u00ab\u00a0L’une des d\u00e9couvertes les plus importantes de notre \u00e9tude est que nous avons pu pr\u00e9dire avec pr\u00e9cision l’origine de nombreux types de cancer diff\u00e9rents en utilisant un tr\u00e8s petit sous-ensemble de marqueurs ADN, soit environ 1 000 r\u00e9gions CpG s\u00e9lectionn\u00e9es parmi des centaines de milliers \u00e0 travers le g\u00e9nome\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 De Velasco. \u00ab\u00a0C’est important car cela montre que nous pouvons simplifier les donn\u00e9es mol\u00e9culaires complexes tout en conservant de solides performances pr\u00e9dictives.\u00a0\u00bb<\/p>\n
Pour les patients atteints de CUP, ce mod\u00e8le pourrait aider les m\u00e9decins \u00e0 abandonner les approches de traitement par essais et erreurs et \u00e0 s\u00e9lectionner \u00e0 la place des th\u00e9rapies adapt\u00e9es au site d’origine probable d’un cancer, a-t-il ajout\u00e9.<\/p>\n
\u00ab\u00a0Nos r\u00e9sultats sugg\u00e8rent que les approches bas\u00e9es sur l’ADN peuvent aider \u00e0 identifier l’endroit o\u00f9 un cancer a pu commencer, m\u00eame lorsque la tumeur d’origine n’est pas visible. En utilisant un ensemble de marqueurs beaucoup plus restreint et plus cibl\u00e9, cette approche pourrait rendre ces types de tests plus pratiques et accessibles \u00e0 l’avenir\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 De Velasco.<\/p>\n
\u00ab Dans l’ensemble, nous consid\u00e9rons cette recherche comme faisant partie d’un effort plus large visant \u00e0 mieux comprendre le cancer \u00e0 l’aide d’informations mol\u00e9culaires, dans le but de soutenir des soins plus inform\u00e9s et personnalis\u00e9s \u00e0 l’avenir. Cependant, ce travail en est encore au stade de la recherche.<\/p>\n
L\u2019une des principales limites de cette \u00e9tude est que le mod\u00e8le a \u00e9t\u00e9 d\u00e9velopp\u00e9 en utilisant des cancers d\u2019origine connue, plut\u00f4t qu\u2019une v\u00e9ritable CUP, ce qui signifie que le mod\u00e8le doit \u00eatre test\u00e9 sur des patients r\u00e9els atteints de CUP pour comprendre ses performances en milieu clinique. Une autre limite est que toutes les tumeurs ne sont pas faciles d\u2019acc\u00e8s pour les tests g\u00e9n\u00e9tiques, en particulier \u00e0 un stade avanc\u00e9. Selon De Velasco, une prochaine \u00e9tape importante de cette recherche consiste \u00e0 adapter et \u00e0 \u00e9valuer ce mod\u00e8le en utilisant une biopsie sanguine pour analyser l’ADN tumoral circulant au lieu de s’appuyer sur l’ADN provenant d’\u00e9chantillons de tissus.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"Un mod\u00e8le d’apprentissage automatique analysant la m\u00e9thylation de l’ADN bas\u00e9e sur CpG a pr\u00e9dit avec pr\u00e9cision l’origine de…\n","protected":false},"author":2,"featured_media":97832,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[9],"tags":[5727,110,27207,27208,83,27205,23036,473,16753,26856,27206,84,9910,23],"class_list":{"0":"post-97831","1":"post","2":"type-post","3":"status-publish","4":"format-standard","5":"has-post-thumbnail","7":"category-sante","8":"tag-cancers","9":"tag-des","10":"tag-digitales","11":"tag-empreintes","12":"tag-health","13":"tag-identifient","14":"tag-ladn","15":"tag-les","16":"tag-metastatiques","17":"tag-methylation","18":"tag-primaires","19":"tag-sante","20":"tag-sites","21":"tag-suisse"},"share_on_mastodon":{"url":"https:\/\/pubeurope.com\/@ch_fr\/116441249384970742","error":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/97831","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=97831"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/97831\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/media\/97832"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=97831"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=97831"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/ch-fr\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=97831"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}