Prvních 126 dní ovlivní rekonstrukce provoz na magistrále. V každém směru ale mají zůstat průjezdné dva jízdní pruhy.
Po celou dobu oprav bude uzavřené parkoviště nad halou. Zastávky expresní linky na letiště a dálkových autobusů se dočasně přesunou do Opletalovy ulice.
Součástí projektu je oprava železobetonové stropní desky, rekonstrukce přilehlých silnic a chodníků, přemístění veřejného osvětlení a výsadba stromů před Fantovou budovou. Změny mají zlepšit také přístup na nádraží od Národního muzea.
Zakázku provede sdružení firem Subterra a Firesta-Fišer. Projekt je financován z úvěru Evropské investiční banky a prostředků Státního fondu dopravní infrastruktury.
Na hlavním nádraží zároveň pokračuje rekonstrukce Fantovy budovy. Současná etapa za 666 milionů korun má skončit v létě 2029. Další plánované změny zahrnují obnovu Vrchlického sadů, novou tramvajovou trať mezi Muzeem a Bolzanovou ulicí a další rekonstrukci odbavovací haly.