Auch der Ostteil der Hauptstadt soll besser an den Flughafen in Schönefeld angebunden werden. Die RB24 aus Eberswalde wird in Schönefeld zum Flughafen verlängert. Von Oranienburg aus soll die RB32 ab Februar 2026 ebenfalls einmal pro Stunde zum BER fahren. Beide Verbindungen führen über das Berliner Ostkreuz, wodurch dort dann zwei Regionalzüge pro Stunde in Richtung Flughafen unterwegs sind.
Für einige gibt es aber auch Nachteile. So fährt der FEX künftig nicht mehr über den Bahnhof Gesundbrunnen im Berliner Norden, der damit keine direkte Regionalbahn-Anbindung mehr an den BER hat. Auch Fahrgäste in Spandau und Falkensee verlieren eine Direktverbindung, denn der RE8 hält künftig nicht mehr am Flughafen. Sie müssen entweder am Hauptbahnhof umsteigen oder mit der S9 durchfahren, doch die Fahrtzeit dieser Verbindung beträgt laut dem Berliner Fahrgastverband IGEB eine Stunde und 19 Minuten.