Jaanitule tegemist peetakse üldiselt meeldivaks kombeks, samas on suurel üheaegsel lõkkepõletamisel ka miinuskülg: see halvendab märkimisväärselt õhu kvaliteeti.
Eesti keskkonnauuringute keskuse õhukvaliteedi ja kliimaosakonna juhataja Erik Teinemaa sõnul näitasid õhu kvaliteedi seire jaamad jaanilaupäeval põletamisega seotud saasteainete kõrgenenud taset peaaegu kõikjal Eestis.