Estonia vraki ümbruses on kehtestatud sukeldumiskeeld, et kaitsta hauarahu. Saksa kohalike ringhäälinguorganisatsioonide WDRi ja NDRi ning päevalehe Süddeutsche Zeitungi ühisuurimise kohaselt on NATO-l aga teavet, et Venemaa kasutab Estonia vrakki veealuste operatsioonide harjutusalana ja on sinna paigutanud ka tehnikat. Seejuures olevat vraki asukoht mitme sõjaväeametniku arvates ideaalne NATO järele luuramiseks.
Mitmel NATO liikmesriigil olevat väljaannete sõnul teavet, et mõni aasta tagasi paigutati Estonia vrakile tehnilisi seadmeid, mis võimaldavad veealuseid droone ja roboteid väga täpselt navigeerida.