![\"Infograf\u00eda](\"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/entender-los-mecanismos-de-reparacion-de-roturas-en-el-adn-tiene-implicaciones-directas-muy-relevant.png\")
@CireniaSketches \/ CNIO.<\/p>\n @CireniaSketches \/ CNIO.<\/p>\n
Felipe Cort\u00e9s, investigador principal del grupo del CNIO que ha creado el ‘reparoma’ humano explica c\u00f3mo se hizo y el por qu\u00e9 de este trabajo, publicado en ‘Science’<\/p>\n
El reparoma humano (REPAIRome en ingl\u00e9s) es el conjunto de los 20.000 tipos de cicatrices que quedan en el ADN humano al ser reparado despu\u00e9s de una rotura<\/p>\n
Son autores del trabajo, adem\u00e1s, Ernesto L\u00f3pez e Israel Selguero, del grupo de Topolog\u00eda y Roturas de ADN del CNIO; y Daniel Gim\u00e9nez, del Grupo de Din\u00e1mica Cromos\u00f3mica del CNIO.<\/p>\n
El investigador del Centro Nacional de Investigaciones Oncol\u00f3gicas (CNIO) Felipe Cort\u00e9s<\/strong> responde aqu\u00ed preguntas b\u00e1sicas sobre el reparoma humano<\/a>, que se presenta en un art\u00edculo publicado en Science. Son autores del trabajo, adem\u00e1s, Ernesto L\u00f3pez<\/strong> e Israel Selguero<\/strong>, del grupo de Topolog\u00eda y Roturas de ADN<\/a> del CNIO; y Daniel Gim\u00e9nez<\/strong>, del Grupo de Din\u00e1mica Cromos\u00f3mica <\/a>del CNIO.<\/p>\n El reparoma humano (REPAIRome en ingl\u00e9s) es el conjunto de los 20.000 tipos de cicatrices que quedan en el ADN humano al ser reparado despu\u00e9s de una rotura. El grupo del CNIO ha identificado estas cicatrices \u2013son las mutaciones que quedan en el ADN despu\u00e9s de la reparaci\u00f3n\u2013, y las ha puesto a disposici\u00f3n de la comunidad cient\u00edfica mundial a trav\u00e9s de la web.<\/p>\n Pregunta: <\/strong>Explic\u00e1is que las cicatrices que quedan en el ADN tras ser reparado var\u00edan seg\u00fan qu\u00e9 genes falten en ese ADN. Y el \u2018reparoma humano\u2019 contiene todos los patrones de cicatrices posibles. Lo hab\u00e9is creado apagando un gen diferente en 20.000 poblaciones celulares distintas; generando roturas en el ADN de las c\u00e9lulas; y observando sus cicatrices despu\u00e9s de la reparaci\u00f3n. \u00bfA qui\u00e9n se le ocurri\u00f3 emprender esta investigaci\u00f3n tan ambiciosa, y por qu\u00e9?<\/p>\n Respuesta:<\/strong> La idea se me ocurri\u00f3 en 2015, antes de estar en el CNIO. Debe de hacer diez a\u00f1os justo ahora porque fue en vacaciones. Ya exist\u00eda la tecnolog\u00eda de an\u00e1lisis masivo para eliminar cada uno de nuestros genes, y comprobar efectos relativamente simples como crecimiento, sensibilidad a f\u00e1rmacos, etc. Hicimos alg\u00fan intento previo, pero hasta que no nos incorporamos al CNIO y empezaron Ernesto, Israel y Daniel a trabajar en el proyecto, no se dieron las circunstancias para poder empezar en serio.<\/p>\n Empleamos un truco sencillo. Con la tecnolog\u00eda de edici\u00f3n gen\u00e9tica CRISPR-Cas generamos de forma simult\u00e1nea listas de cientos de reparaciones que se produc\u00edan cuando faltaba cada uno de los 20.000 genes. Desde el principio sab\u00edamos que ten\u00eda que funcionar, y que ser\u00eda un avance importante. La duda era si \u00edbamos a poder hacerlo a gran escala. Y empezamos con experimentos previos para determinarlo.<\/p>\n \u00bfOtros grupos en el mundo tambi\u00e9n lo estaban intentando?<\/strong><\/p>\n En 2021, justo cuando ten\u00edamos ya las condiciones puestas a punto, sali\u00f3 un estudio en Cell que usaba nuestra misma tecnolog\u00eda, pero en un grupo reducido de genes (unos 400) de los que ya se conoc\u00eda que ten\u00edan una funci\u00f3n en la reparaci\u00f3n del ADN.<\/p>\n Fue un inconveniente importante, porque las revistas top valoran fundamentalmente la novedad y pod\u00eda limitar nuestra publicaci\u00f3n futura. Pero finalmente decidimos seguir adelante, porque ese estudio, al limitarse a genes con funci\u00f3n conocida, no aportaba mucho al conocimiento de los mecanismos de reparaci\u00f3n. Pensamos que hacerlo con todos los genes, adem\u00e1s de generar una herramienta de consulta muy \u00fatil para toda la comunidad cient\u00edfica, podr\u00eda resultar en nuevos descubrimientos, como as\u00ed ha sido.<\/p>\n \u00bfHab\u00e9is tardado lo que hab\u00edais previsto?<\/strong><\/p>\n Desde que tomamos esta decisi\u00f3n el proceso ha sido muy r\u00e1pido, teniendo en cuenta la envergadura del proyecto: solo cuatro a\u00f1os desde el inicio del experimento hasta tener la publicaci\u00f3n es realmente muy poco tiempo.<\/p>\n Sabemos que hay al menos otro grupo que tambi\u00e9n ha realizado un estudio similar, aunque todav\u00eda no lo han publicado. Los resultados ser\u00e1n complementarios porque, hasta donde sabemos, lo han realizado en una l\u00ednea celular diferente. En nuestro estudio ya vemos que las cicatrices cambian de unos tipos celulares a otros.<\/p>\n Tenemos el proteoma humano, el interactoma, el transcriptoma\u2026 \u00bfQu\u00e9 peso tiene el reparoma entre todas esas \u2018\u00f3micas\u2019?<\/strong><\/p>\n Es una nueva capa de conocimiento gen\u00f3mico que puede integrarse con todas estas otras. Por ejemplo, es muy interesante comparar la similitud entre patrones en el reparoma con el interactoma conocido. Se observa que factores que forman parte de un mismo complejo, o con interacciones funcionales relevantes, tienen un impacto parecido en las cicatrices.<\/p>\n De hecho, es algo que hemos utilizado para identificar nuevos genes implicados en reparaci\u00f3n, y este an\u00e1lisis de interacciones funcionales est\u00e1 integrado en nuestra web de consulta del reparoma.<\/p>\n \u00a0\u00bfQu\u00e9 preguntas ayudar\u00e1 a resolver el reparoma a corto plazo? \u00bfY m\u00e1s all\u00e1?<\/strong><\/p>\n De forma inmediata puede usarse como una herramienta de consulta. Por ejemplo, si se identifica un gen del que se sospecha que puede tener una funci\u00f3n en reparaci\u00f3n de roturas, o que puede afectar a la acumulaci\u00f3n de mutaciones en c\u00e1ncer, se podr\u00eda confirmar simplemente mirando en la web del reparoma.<\/p>\n A corto-medio plazo se pueden emplear los datos generados para identificar nuevos factores y relaciones entre rutas de reparaci\u00f3n, posibles explicaciones a patrones mutacionales y dianas terap\u00e9uticas para el tratamiento del c\u00e1ncer. En la publicaci\u00f3n solo hemos seleccionado, validado y caracterizado una serie de ejemplos para ilustrar lo que el reparoma puede hacer; hay mucha m\u00e1s informaci\u00f3n ah\u00ed que ahora est\u00e1 disponible a toda la comunidad cient\u00edfica.<\/p>\n Conceptualmente, \u00bfpor qu\u00e9 la c\u00e9lula ha aprendido a reparar roturas, en lugar de a evitarlas?<\/strong><\/p>\n Tambi\u00e9n hay mecanismos para evitarlas. Pero es inevitable que algunas ocurran. Es curioso, pero la c\u00e9lula tambi\u00e9n usa las roturas de forma activa para procesos en los que necesita generar variabilidad gen\u00e9tica.<\/p>\n Es el caso de la formaci\u00f3n de gametos, que genera variabilidad para la siguiente generaci\u00f3n, y la maduraci\u00f3n de linfocitos, que generan un repertorio suficientemente variable y extenso de receptores y anticuerpos que puedan reconocer a cualquier pat\u00f3geno. En estos casos se promueven tipos de reparaci\u00f3n muy propensos a generar cicatrices.\u00a0<\/p>\n \u00bfPor qu\u00e9 es importante entender los mecanismos de reparaci\u00f3n de roturas?<\/strong><\/p>\n Tienen implicaciones directas muy relevantes para la salud. La reparaci\u00f3n incorrecta resulta en acumulaci\u00f3n de mutaciones e inestabilidad gen\u00f3mica, que est\u00e1n estrechamente relacionadas con el desarrollo y la progresi\u00f3n tumoral, y tambi\u00e9n con el envejecimiento.<\/p>\n Por otro lado, muchos de los agentes antitumorales cl\u00e1sicos se basan en matar a las c\u00e9lulas cancerosas induciendo roturas en su ADN, por lo que los factores encargados de la reparaci\u00f3n de estas roturas son buenas dianas para aumentar la eficacia de estos tratamientos.<\/p>\n En este sentido, como hay varias formas diferentes de reparar las roturas, conocer los mecanismos de reparaci\u00f3n activos en cada tumor es muy relevante para dise\u00f1ar tratamientos personalizados. Aunque de forma m\u00e1s indirecta, los mecanismos de reparaci\u00f3n tambi\u00e9n influyen en la inmunogenicidad tumoral, y por tanto en los tratamientos de inmunoterapia.<\/p>\n Finalmente, la generaci\u00f3n dirigida de roturas en el ADN es la base de la edici\u00f3n g\u00e9nica por las tecnolog\u00edas CRIPS-Cas y, de hecho, es lo que hemos usado para generar el reparoma. Conocer los mecanismos de reparaci\u00f3n es por tanto fundamental para el desarrollo de t\u00e9cnicas de edici\u00f3n g\u00e9nica eficientes y controladas.<\/p>\n \u00bfPor qu\u00e9 las cicatrices en el ADN reparado son distintas seg\u00fan qu\u00e9 genes est\u00e9n o no en el ADN?<\/strong><\/p>\n Los genes que est\u00e9n o no en el ADN van a determinar las prote\u00ednas que est\u00e9n presentes para reparar la rotura en la c\u00e9lula. Existen numerosas rutas para reparar las roturas que se apoyan, solapan y compiten entre ellas. Cada una depende de m\u00faltiples prote\u00ednas de forma directa, y tambi\u00e9n de factores indirectos, como el estado general de la c\u00e9lula. Las ausencia o presencia de cada una de estas prote\u00ednas va a determinar qu\u00e9 rutas de reparaci\u00f3n se empleen y, por tanto, el resultado final de la reparaci\u00f3n.<\/p>\n El reparoma humano est\u00e1 a disposici\u00f3n de la comunidad cient\u00edfica internacional. \u00bfQu\u00e9 area de investigaci\u00f3n crees que recurrir\u00e1 a esta web en primer lugar?<\/strong><\/p>\n Va a atraer la atenci\u00f3n inmediata de los campos de la reparaci\u00f3n del ADN e inestabilidad gen\u00f3mica y de las tecnolog\u00edas CRISPR y edici\u00f3n g\u00e9nica. Esperamos que tambi\u00e9n atraiga a los interesados en la evoluci\u00f3n tumoral. Poco a poco pensamos que puede convertirse en una herramienta de referencia para el resto de la comunidad cient\u00edfica.<\/p>\n \u00bfCu\u00e1l ser\u00e1 el paso siguiente de vuestra investigaci\u00f3n?<\/strong><\/p>\n Nuestra idea ahora es expandir los resultados con nuevos tipos celulares y condiciones espec\u00edficas, combinando la inactivaci\u00f3n de varios genes y a\u00f1adiendo m\u00e1s mutaciones a nuestro an\u00e1lisis.<\/p>\n Con una cantidad de datos suficientemente extensa, y aplicando modelos de IA, deber\u00edamos ser capaces de \u201cdecodificar\u201d la relaci\u00f3n entre el estado gen\u00e9tico y patrones mutacionales en condiciones reales m\u00e1s complejas que la ausencia de genes individuales, que es el primer paso que hemos dado ahora. Esto tendr\u00eda una gran relevancia para establecer tratamientos personalizados, predecir la evoluci\u00f3n de tumores y controlar de forma precisa la edici\u00f3n g\u00e9nica.<\/p>\n Sobre el Centro Nacional de Investigaciones Oncol\u00f3gicas (CNIO)<\/strong><\/p>\n El Centro Nacional de Investigaciones Oncol\u00f3gicas (CNIO) es un centro p\u00fablico de investigaci\u00f3n dependiente del Ministerio de Ciencia, Innovaci\u00f3n y Universidades.\u00a0Es el mayor centro de investigaci\u00f3n en c\u00e1ncer en Espa\u00f1a y uno de los m\u00e1s importantes en Europa. Integra a medio millar de cient\u00edficos y cient\u00edficas, m\u00e1s el personal de apoyo, que trabajan para mejorar la prevenci\u00f3n, el diagn\u00f3stico y el tratamiento del c\u00e1ncer.<\/p>\n Art\u00edculo de referencia<\/p>\n Ernesto L\u00f3pez de Alba, Israel Salguero, Daniel Gim\u00e9nez- Llorente, Javier Montes-Torres, \u00c1ngel Fern\u00e1ndez- Sanrom\u00e1n, Ester Casaj\u00fas- Pelegay, Jos\u00e9 Terr\u00f3n- Bautista, Jonathan Barroso- Gonz\u00e1lez, Juan A. Bernal, Geoff Macintyre, Rafael Fern\u00e1ndez- Leiro, Ana Losada, Felipe Cort\u00e9s- Ledesma, A comprehensive genetic catalog of human double-strand break repair, Science, 2 october 2025![\"Desde](\"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-content\/uploads\/2025\/10\/felipe-cortes-entender-los-mecanismos-de-reparacion-de-roturas-en-el-adn-tiene-implicaciones-directa.jpeg\")
Desde la izda.: Ernesto L\u00f3pez, Felipe Cort\u00e9s, Daniel Gim\u00e9nez e Israel Selguero. \/ Marina Bejarano. CNIO.<\/p>\n
DOI: 10.1126\/science.adr5048<\/p>\n