{"id":298938,"date":"2025-12-21T02:37:24","date_gmt":"2025-12-21T02:37:24","guid":{"rendered":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/298938\/"},"modified":"2025-12-21T02:37:24","modified_gmt":"2025-12-21T02:37:24","slug":"rnacorex-el-software-abierto-de-la-universidad-de-navarra-que-identifica-redes-geneticas-del-cancer-y-predice-supervivencia","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/298938\/","title":{"rendered":"RNACOREX, el software abierto de la Universidad de Navarra que identifica redes gen\u00e9ticas del c\u00e1ncer y predice supervivencia"},"content":{"rendered":"<p><strong>RNACOREX<\/strong>\u00a0 es el nuevo software de <strong>c\u00f3digo abierto<\/strong> que ha desarrollado la <a href=\"https:\/\/navarra.okdiario.com\/articulo\/sociedad\/tecnica-clinica-universidad-navarra-consigue-curar-agresivo-cancer-necesidad-operar\/20250612090705597411.html\" rel=\"nofollow noopener\" target=\"_blank\"><strong>Universidad de Navarra<\/strong><\/a> para ayudar a \u201cleer\u201d las <a href=\"https:\/\/navarra.okdiario.com\/articulo\/sociedad\/clinica-cientificos-clinica-universidad-navarra-logran-erradicar-recaida-cancer-mama-mas-agresivo-laboratorio\/20250728103354609143.html\" rel=\"nofollow noopener\" target=\"_blank\">redes gen\u00e9ticas ocultas del <strong>c\u00e1ncer<\/strong><\/a> y mejorar el an\u00e1lisis de supervivencia.<\/p>\n<p>La herramienta la han creado investigadores del <strong>Instituto de Ciencia de los Datos e Inteligencia Artificial (DATAI)<\/strong> y del <strong>Cancer Center Cl\u00ednica Universidad de Navarra<\/strong>, y la han validado con datos de trece tumores del consorcio internacional <strong>The Cancer Genome Atlas (TCGA)<\/strong>.<\/p>\n<p>El estudio se ha publicado en <strong>PLOS Computational Biology<\/strong> y ha explicado que <strong>RNACOREX<\/strong> analiza miles de mol\u00e9culas a la vez para detectar <strong>interacciones<\/strong> clave que suelen pasar desapercibidas con m\u00e9todos convencionales.<\/p>\n<p>Con ese an\u00e1lisis, el programa ha ofrecido un \u201c<strong>mapa<\/strong>\u201d interpretable que ha ayudado a comprender mejor la base <strong>molecular<\/strong> de los tumores y ha abierto nuevas v\u00edas para estudiar los mecanismos que impulsan la progresi\u00f3n tumoral.<\/p>\n<p>En las c\u00e9lulas interact\u00faan mol\u00e9culas como los <strong>microARN (miRNA)<\/strong> y el <strong>ARN mensajero (ARNm)<\/strong>, formando una compleja red de <strong>regulaci\u00f3n<\/strong>. Cuando esas redes se alteran, pueden aparecer enfermedades como el <strong>c\u00e1ncer<\/strong>.<\/p>\n<p>\u201cComprender c\u00f3mo se organizan estas redes es clave para detectar, estudiar y clasificar distintos tipos de tumores\u201d, ha explicado <strong>Rub\u00e9n Arma\u00f1anzas<\/strong>, l\u00edder del <strong>Laboratorio de Medicina Digital<\/strong> de DATAI y uno de los autores principales, que tambi\u00e9n ha subrayado el reto de separar se\u00f1ales reales de muchas se\u00f1ales falsas.<\/p>\n<p>En ese contexto, <strong>RNACOREX<\/strong> ha combinado informaci\u00f3n de <strong>bases de datos<\/strong> internacionales con datos reales de <strong>expresi\u00f3n g\u00e9nica<\/strong>. Con todo ello, ha generado un ranking de interacciones fiables entre miARN y ARNm seg\u00fan su relevancia biol\u00f3gica.<\/p>\n<p>A partir de ese ranking, la herramienta ha construido redes de <strong>regulaci\u00f3n<\/strong> con creciente orden de complejidad que pueden usarse como <strong>modelos probabil\u00edsticos<\/strong>. \u00bfQu\u00e9 aporta esto al laboratorio? Un esquema m\u00e1s claro para priorizar qu\u00e9 relaciones moleculares merecen atenci\u00f3n.<\/p>\n<p>El equipo ha evaluado <strong>RNACOREX<\/strong> en trece tipos de <strong>c\u00e1ncer<\/strong> \u2014entre ellos mama, colon, pulm\u00f3n, est\u00f3mago, melanoma, cabeza y cuello\u2014 con datos de <strong>TCGA<\/strong>. \u201cLos an\u00e1lisis mostraron que la herramienta es capaz de predecir la probabilidad de supervivencia con un rendimiento comparable o superior al de modelos avanzados de inteligencia artificial\u201d, ha se\u00f1alado <strong>Aitor Oviedo-Madrid<\/strong>, primer autor del trabajo.<\/p>\n<p>Adem\u00e1s, el software ofrece explicaciones claras sobre qu\u00e9 <strong>interacciones moleculares<\/strong> han sustentado cada predicci\u00f3n, lo que lo situa como alternativa a modelos de \u201c<strong>caja negra<\/strong>\u201d. Seg\u00fan Oviedo-Madrid, \u201cnuestra herramienta nos permite contar con un mapa molecular fiable que facilita priorizar nuevas dianas biol\u00f3gicas y orientar experimentos\u201d.<\/p>\n<p>La Universidad de Navarra explica\u00a0que <strong>RNACOREX<\/strong> est\u00e1 disponible en <strong>GitHub<\/strong> y tambi\u00e9n en <strong>PyPI<\/strong>, e incluye una funci\u00f3n de descarga autom\u00e1tica de las bases de datos necesarias, para facilitar su adopci\u00f3n en centros de investigaci\u00f3n.<\/p>\n<p>El proyecto lo han financiado parcialmente el <strong>Gobierno de Navarra<\/strong> (programa ANDIA 2021) y el <strong>ERA PerMed JTC2022 PORTRAIT<\/strong>, y el equipo ya ha trabajado en nuevas funcionalidades, como el an\u00e1lisis de <strong>rutas biol\u00f3gicas<\/strong> y la incorporaci\u00f3n de m\u00e1s tipos de <strong>interacciones<\/strong> para explicar mejor la progresi\u00f3n tumoral.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"RNACOREX\u00a0 es el nuevo software de c\u00f3digo abierto que ha desarrollado la Universidad de Navarra para ayudar a&hellip;\n","protected":false},"author":2,"featured_media":298939,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[92],"tags":[1066,25,24,165,1294,708,1358,166,23,71039],"class_list":{"0":"post-298938","1":"post","2":"type-post","3":"status-publish","4":"format-standard","5":"has-post-thumbnail","7":"category-salud","8":"tag-cancer","9":"tag-es","10":"tag-espana","11":"tag-health","12":"tag-investigacion","13":"tag-navarra","14":"tag-pamplona","15":"tag-salud","16":"tag-spain","17":"tag-universidad-de-navarra"},"share_on_mastodon":{"url":"https:\/\/pubeurope.com\/@es\/115755237238826960","error":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/298938","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=298938"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/298938\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media\/298939"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=298938"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=298938"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.europesays.com\/es\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=298938"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}