La t\u00e9cnica, denominada GenRewire, permite reorientar las funciones presentes en el genoma de las prote\u00ednas para que las bacterias desarrollen nuevas capacidades, sin comprometer su funcionamiento natural.<\/p>\n
En biotecnolog\u00eda es muy com\u00fan la utilizaci\u00f3n de ingenier\u00eda gen\u00e9tica para dotar a las bacterias de nuevas capacidades que les permitan, por ejemplo, producir sustancias de inter\u00e9s industrial o m\u00e9dico o degradar contaminantes ambientales. Sin embargo, hasta ahora, la alteraci\u00f3n de las funciones celulares bacterianas se consegu\u00eda introduciendo material gen\u00e9tico externo en las c\u00e9lulas a trav\u00e9s de diferentes t\u00e9cnicas y elementos, como los pl\u00e1smidos, unas peque\u00f1as mol\u00e9culas de ADN extracromos\u00f3mico capaces de moverse de una bacteria a otra.<\/p>\n
Frente a las t\u00e9cnicas tradicionales de ingenier\u00eda gen\u00e9tica, que dependen de la introducci\u00f3n de ADN for\u00e1neo, un estudio publicado hoy en la revista\u00a0Trends in Biotechnology\u00a0plantea un cambio de paradigma. \u201cNuestro m\u00e9todo parte de una idea sencilla: si las prote\u00ednas nativas pueden ser redise\u00f1adas computacionalmente para hacer algo nuevo, no necesitamos alterar el equilibrio gen\u00e9tico de la c\u00e9lula con elementos externos\u201d, explica\u00a0Manuel Ferrer<\/strong>, investigador del CSIC en el Instituto de Cat\u00e1lisis y Petroleoqu\u00edmica (ICP-CSIC<\/a>) y coordinador del estudio.<\/p>\n Una bacteria que no degrada pl\u00e1stico\u2026 hasta ahora<\/p>\n Con el objetivo de validar la tecnolog\u00eda desarrollada, los cient\u00edficos han aplicado este m\u00e9todo para dotar a la bacteria\u00a0Escherichia coli\u00a0de la capacidad de degradar part\u00edculas de pl\u00e1stico PET (Polietileno Tereftalato) de tama\u00f1o nanom\u00e9trico. Se trata de nanopl\u00e1sticos<\/a> omnipresentes en nuestra vida cotidiana, utilizados en la fabricaci\u00f3n de envases o en la industria textil, que se han convertido en contaminantes con un alto impacto en el medioambiente y en la salud.<\/p>\n Este logro se ha conseguido mediante la reprogramaci\u00f3n de dos prote\u00ednas de la bacteria, sin necesidad de insertar genes externos. \u201cNuestro enfoque es \u00fanico, porque combina inteligencia artificial, simulaci\u00f3n por supercomputaci\u00f3n y edici\u00f3n gen\u00e9tica precisa para incorporar nuevas actividades en prote\u00ednas naturales\u201d, afirma\u00a0V\u00edctor Guallar<\/strong>, investigador del BSC<\/a> y coordinador del estudio. Las prote\u00ednas modificadas sustituyen a las originales en el genoma, lo que permite a la c\u00e9lula mantener su equilibrio biol\u00f3gico.<\/p>\n Adem\u00e1s, la t\u00e9cnica GenRewire destaca por su sencillo funcionamiento: consiste en analizar en un supercomputador las prote\u00ednas codificadas por un genoma y, posteriormente, reprogramarlas mediante herramientas computacionales para que realicen una funci\u00f3n deseada. \u201cReprogramamos la bacteria virtual en tan solo tres o cuatro semanas, gracias a los recientes avances en m\u00e9todos estructurales de IA, en nuestros algoritmos de simulaci\u00f3n mec\u00e1nica y al poder de supercomputaci\u00f3n del MareNostrum 5\u201d, afirma\u00a0Joan Gim\u00e9nez<\/strong>, investigador del BSC y uno de los primeros autores del estudio.<\/p>\n Una herramienta clave para reprogramar genomas sin introducir ADN externo<\/p>\n Mientras que los m\u00e9todos habituales a\u00f1aden genes ex\u00f3genos para que las bacterias hagan algo nuevo, GenRewire consigue el mismo resultado sin introducir ADN externo. \u201cAs\u00ed se evitan problemas como que las bacterias crezcan peor o que el sistema sea poco estable. Hemos demostrado que es posible redise\u00f1ar bacterias desde dentro, sin alterar su naturaleza con elementos externos\u201d, explican\u00a0Paula Vidal<\/strong>\u00a0y\u00a0Laura Fern\u00e1ndez<\/strong>, investigadoras del CSIC en el Instituto de Cat\u00e1lisis y Petroleoqu\u00edmica y tambi\u00e9n primeras autoras del estudio. \u201cHemos demostrado que esta tecnolog\u00eda puede complementar la ingenier\u00eda metab\u00f3lica cl\u00e1sica, haciendo que bacterias como\u00a0Escherichia coli\u00a0degraden pl\u00e1stico y transformen sus residuos en productos valiosos\u201d, a\u00f1aden.<\/p>\n Seg\u00fan los investigadores, este m\u00e9todo podr\u00e1 aplicarse a otros organismos y convertirse en una herramienta clave para reprogramar genomas sin necesidad de introducir prote\u00ednas o genes externos. \u201cEsto, aplicado, por ejemplo, al genoma humano o a cultivos, no solo reduce el riesgo de rechazo por parte del sistema inmunol\u00f3gico, sino que tambi\u00e9n ayuda a superar las barreras legales y \u00e9ticas que suelen plantearse al usar ADN ajeno\u201d, concluyen.<\/p>\n Referencia cient\u00edfica:<\/p>\n Paula Vidal, Joan Gim\u00e9nez-Dejoz, Laura Fern\u00e1ndez-L\u00f3pez, Sonia Romero, Seyed Amirabbas Nazemi, Miguel Luengo, Jos\u00e9 L. Gonz\u00e1lez-Alfonso, Mireia Mart\u00ednez-Sugra\u00f1es, Ana Robles Mart\u00edn, David Almendral, Sergi Roda, Pablo P\u00e9rez-Garc\u00eda, Luzie Kruse, Karl-Erich Jaeger, Wolfgang R. Streit, Francisco J. Plou, Mart\u00edn Piso, Patrick Shahgaldian, Rafael Bargiela, V\u00edctor Guallar, Manuel Ferrer.\u00a0\u2018Computationally guided genome rewiring of\u00a0Escherichia coli\u00a0and its application for nanopolyethylene terephthalate (PET) biodegradation and upcycling\u2019.\u00a0Trends in Biotechnology. DOI:\u00a0https:\/\/doi.org\/10.1016\/j.tibtech.2025.07.008<\/a><\/p>\n