C’est désormais un fait établi. Ce qui se passe dans notre ventre a des répercussions sur l’ensemble de notre santé : apparition d’une dépression, maladies auto-immunes, obésité, maladies neurodégénératives… Le lieu où cela se joue ? Les intestins et son microbiote. Ce dernier peut peser plus d’un kilogramme et comprend des milliards de bactéries vivantes, d’une centaine d’espèces différentes, selon l’Inserm. Mais l’équilibre de cet écosystème est fragile. Il peut être perturbé par ce que nous mangeons et buvons, par le stress ou par des polluants. Les médicaments ne font pas exception. Des chercheurs estoniens ont découvert que certains d’entre eux pouvaient avoir un impact sur notre microbiote pendant plusieurs années. Leur étude est parue le 5 septembre 2025 dans la revue mSystems.

Les antibiotiques tuent aussi les bactéries du microbiote

Les chercheurs ont épluché les données de plus de 2 500 Estoniens inscrits dans le programme Estonian Biobank, qui recense les informations de santé des participants. Ces derniers ont aussi partagé des échantillons de salive, de selles et de sang. Un peu plus de 300 d’entre eux ont envoyé un deuxième prélèvement de selles plus de quatre ans plus tard, ce qui a servi de point de comparaison pour les chercheurs. Il était déjà connu que les antibiotiques affaiblissent le microbiote intestinal. Et c’est plutôt logique. Ils sont faits pour tuer les bactéries pathogènes, c’est-à-dire (…)

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