Rafał Trzaskowski pojawił się podczas nadzwyczajnej sesji Rady Warszawy, która została zorganizowana w sprawie afery w Szpitalu Południowym w Warszawie. Zapewnił, że przy wyjaśnieniu sprawy nie będzie żadnej ochrony ze względu na funkcje, znajomości czy polityczne powiązania. Patologie Szpitala Południowego. Znany ordynator przyznaje: w środowisku się o tym mówiło 
Rafał Trzaskowski ostrzega w sprawie afery w Szpitalu Południowym
Jednocześnie prezydent Warszawy zaznaczył, że jeśli zarzuty w sprawie Szpitala Południowego okażą się nieprawdziwe, to „konsekwencje powinni ponieść także ci, którzy je formułują”.
W dalszej części swojego przemówienia Trzaskowski zaznaczył, że odwołanie zarządu placówki było jak najbardziej zasadne, ponieważ okazało się, że nie było w niej jednolitego systemu rozliczania czasu pracy. Ponadto nawiązał do informacji o saloniku VIP, w którym poza kolejką mieli być przyjmowani politycy KO. W jego ocenie Dawid Kacprzyk prawdopodobnie miał samowolnie wykorzystywać do tego celu jedno z pomieszczeń. Kwestię tę mają wyjaśnić teraz audytorzy.
Krzyki po przemówieniu prezydenta Warszawy Rafała Trzaskowskiego. Mamy nagranie
Gdy Rafał Trzaskowski zakończył swoje przemówienie, na sali rozległy się krzyki.
— krzyczeli zgromadzeni.
— Proszę, żebyście się państwo nie wydzierali — mówił prowadzący obrady wiceprzewodniczący rady Sławomir Potapowicz.