A FCT passou a ser apenas a entidade financiadora dos projetos, sendo agora cada universidade responsável pelo processamento, o que implica análise de documentação dos investigadores com bolsas de doutoramento. A Associação dos Bolseiros de Investigação Científica (ABIC) tem denunciado problemas na transição deste processo, que terão resultado, nalguns casos, na demora e em pagamentos feitos este mês de projetos aprovados em agosto e cujos contratos iniciaram a 1 de setembro.
