Podia ser uma festa a três em duas provas diferentes, tornou-se numa festa mais pequena a dois e restrita a uma só competição. O Sp. Braga confirmou o seu teórico favoritismo frente ao modesto Lincoln Red Imps, de Gibraltar, e passou o playoff para se juntar ao FC Porto no sorteio da Liga Europa com duas goleadas. Em contrapartida, o Santa Clara não conseguiu repetir a façanha do V. Guimarães na última temporada, caindo no playoff da Liga Conferência com os irlandeses do Shamrock Rovers e falhando a presença no sorteio da primeira fase. Se uma das grandes novidades da UEFA para a presente época passava pela realização dos dois sorteios depois da Liga dos Campeões em simultâneo, Portugal só estaria representado na Liga Europa.
À semelhança da temporada passada, o FC Porto voltava a surgir como cabeça de série, neste caso com uma posição reforçada de segunda equipa com maior coeficiente da UEFA apenas superado pela Roma (no ano passado havia também o Manchester United), ao passo que o Sp. Braga entrava de novo no pote 2, sendo a segunda melhor equipa desse grupo atrás do Fenerbahçe, que anunciou a saída de José Mourinho na manhã desta sexta-feira após a eliminação da Liga dos Campeões frente ao Benfica. E a sorte seria ditada por uma cara conhecida do futebol: Jürgen Klinsmann, antigo avançado campeão mundial pela Alemanha que ganhou a então Taça UEFA em 1991 pelos italianos do Inter e em 1996 pelos alemães do Bayern (e que passou também no final da carreira pelo Tottenham, que ganhou a última edição da prova frente ao United).
Essa não seria a única surpresa… e com ligação nacional: se Klinsmann foi um autêntico quebra cabeças para as equipas portuguesas na década de 90, era tempo de entrar no palco o mágico Mário Daniel, que levou à letra os novos tempos de sorteio e fez desaparecer todas as 36 bolas que estavam preparadas para o sorteio, abrindo espaço para o supercomputador começar a divulgar os adversários de FC Porto e Sp. Braga nesta primeira fase da Liga Europa. Em resumo, o sorteio acabou por ser “acessível” para os dois conjuntos nacionais (mais para os dragões), com quatro adversários em comum entre ambos (Rangers, Nice, Estrela Vermelha e Nottingham Forest), viagens aos Países Baixos (Utrecht e Go Ahead Eagles) e o reencontro com Nuno Espírito Santo, antigo técnico dos dragões que comanda agora a formação do Nottingham Forest.
- Pote 1: Rangers (casa) e Salzburgo (fora)
- Pote 2: Estrela Vermelha (casa) e Viktoria Plzen (fora)
- Pote 3: Nice (casa) e Nottingham Forest (fora)
- Pote 4: Malmö (casa) e Utrecht (fora)
- Pote 1: Feyenoord (casa) e Rangers (fora)
- Pote 2: Estrela Vermelha (casa) e Celtic (fora)
- Pote 3: Nottingham Forest (fora) e Nice (casa)
- Pote 4: Genk (casa) e Go Ahead Eagles (fora)
- Jornada 1, 24 e 25 de setembro
- Jornada 2, 2 de outubro
- Jornada 3, 23 de outubro
- Jornada 4, 6 de novembro
- Jornada 5, 27 de novembro
- Jornada 6, 11 de dezembro
- Jornada 7, 22 de janeiro
- Jornada 8, 29 de janeiro
- França: 3 equipas (mais uma do que em 2024/25)
- Países Baixos: 3 equipas (mais uma do que em 2024/25)
- Espanha: 2 equipas (igual a 2024/25)
- Inglaterra: 2 equipas (igual a 2024/25)
- Alemanha: 2 equipas (igual a 2024/25)
- Itália: 2 equipas (igual a 2024/25)
- Portugal: 2 equipas (igual a 2024/25)
- Escócia: 2 equipas (mais uma do que em 2024/25)
- Áustria: 2 equipas (mais duas do que em 2024/25)
- Grécia: 2 equipas (igual a 2024/25)
- Suíça: 2 equipas (mais duas do que em 2024/25)
- Bélgica: 1 equipa (menos uma do que em 2024/25)
- Turquia: 1 equipa (menos duas do que em 2024/25)
- Sérvia: 1 equipa (mais uma do que em 2024/25)
- Croácia: 1 equipa (mais uma do que em 2024/25)
- Rep. Checa: 1 equipa (menos uma do que em 2024/25)
- Hungria: 1 equipa (igual a 2024/25)
- Noruega: 1 equipa (igual a 2024/25)
- Israel: 1 equipa (igual a 2024/25)
- Bulgária: 1 equipa (igual a 2024/25)
- Dinamarca: 1 equipa (igual a 2024/25)
- Suécia: 1 equipa (menos uma do que em 2024/25)
- Nota: Azerbaijão, Ucrânia e Letónia não estarão representadas na Liga Europa como aconteceu em 2024/25
Pote 1
- Roma (Itália), FC Porto (Portugal), Rangers (Escócia), Feyenoord (Países Baixos), Lille (França), Dínamo Zagreb (Croácia), Betis (Espanha), Salzburgo (Áustria) e Aston Villa (Inglaterra)
Pote 2
- Fenerbahçe (Turquia), Sp. Braga (Portugal), Estrela Vermelha (Sérvia), Lyon (França), PAOK (Grécia), Viktoria Plzen (Rep. Checa), Ferencvaros (Hungria), Celtic (Escócia) e Maccabi Telavive (Israel)
Pote 3
- Young Boys (Suíça), Basileia (Suíça), Midtjylland (Dinamarca), Friburgo (Alemanha), Ludogorets (Bulgária), Nottingham Forest (Inglaterra), Sturm Graz (Áustria), Steaua Bucareste (Roménia) e Nice (França)
Pote 4
- Bolonha (Itália), Celta de Vigo (Espanha), Estugarda (Alemanha), Panathinaikos (Grécia), Malmö (Suécia), Go Ahead Eagles (Países Baixos), Utrecht (Países Baixos), Genk (Bélgica) e Brann (Noruega)
- Maccabi Telavive (Israel)-Dínamo Kiev (Ucrânia), 3-1 e 0-1
- Shkëndija (Macedónia)-Ludogorets (Bulgária), 2-1 e 1-4 (a.p.)
- Slovan Bratislava (Eslováquia)-Young Boys (Suíça), 0-1 e 2-3
- Malmö (Suécia)-Sigma Olomouc (Rep. Checa), 3-0 e 2-0
- Panathinaikos (Grécia)-Samsunspor (Turquia), 2-1 e 0-0
- Aberdeen (Escócia)-Steaua Bucareste (Roménia), 2-2 e 0-3
- Lech Poznan (Polónia)-Genk (Bélgica), 1-5 e 2-1
- Midtjylland (Dinamarca)-KuPS (Finlândia), 4-0 e 2-0
- Lincoln Red Imps (Gibraltar)-Sp. Braga (Portugal), 0-4 e 1-5
- Zrinjski (Bósnia)-Utrecht (Países Baixos), 0-2 e 0-0
- Brann (Noruega)-AEK Larnaca (Chipre), 2-1 e 4-0
- Rijeka (Croácia)-PAOK (Grécia), 1-0 e 0-5
- Fenerbahçe (Hungria)-Qarabag (Azerbaijão), 1-3 e 3-2
- Estrela Vermelha (Sérvia)-Pafos (Chipre), 1-2 e 1-1
- Bodö/Glimt (Noruega)-Sturm Graz (Áustria), 5-0 e 1-2
- Celtic (Escócia)- Kairat Almaty (Cazaquistão), 0-0 e 0-0 (2-3, g.p.)
- Basileia (Suíça)-Copenhaga (Dinamarca), 1-1 e 0-2
- Fenerbahçe (Turquia)-Benfica (Portugal), 0-0 e 0-1
- Rangers (Escócia)-Club Brugge (Bélgica), 1-3 e 6-0