Det säger landets energiminister Saad al-Kaabi i en intervju med Financial Times.
Enligt ministern kan bolag i regionen behöva åberopa force majeure om konflikten fortsätter.
Kaabi sade att även om kriget skulle upphöra omedelbart skulle det ta Qatar ”veckor till månader” att återgå till en normal leveranscykel.
Qatar stoppade i veckan sin produktion av flytande naturgas efter iranska attacker mot Gulfstater. Landets LNG-produktion motsvarar omkring 20 procent av den globala tillgången och är central för energiförsörjningen i både Asien och Europa.
Kaabis varning har fått börserna att vända nedåt under fredagen efter initiala uppgångar.