Sex fall av hantavirus har enligt WHO bekräftats efter utbrottet på kryssningsfartyget. Totalt åtta misstänkta fall har rapporterats, varav tre dödsfall.
Tidigt på söndagsmorgonen väntas fartyget angöra Teneriffa där passagerarna ska gå i land för att flygas till sina hemländer.
WHO-chefen säger till öns invånare att risken att smittas av det farliga viruset är liten.
– Det här är inte covid. Folkhälsorisken från hantavirus är låg, säger han.
På lördagen håller Tedros Adhanom Ghebreyesus också samtal med Spaniens premiärminister Pedro Sánchez.