Generalerna meddelar att de stänger landets gränser och häver valprocessen.
Parlaments- och presidentval hölls i den lilla västafrikanska nationen i söndags. Efteråt utropade både den sittande presidenten Umaro Sissoco Embaló och utmanaren Fernando Dias seger, vilket bidragit till växande oro i landet som drabbats av ett antal kupper på senare år.
Uppgifterna om skottlossning i huvudstaden Bissau kom på onsdagseftermiddagen. Det har också kommit obekräftade rapporter om att Embaló gripits.
Presidenten säger i onsdagens telefonintervju med France 24 att han ”har blivit avsatt”. Han tillägger att han inte kan uttala sig mer ingående eftersom han riskerar att få sin telefon konfiskerad.
Han säger dock att han befinner sig på generalstabens högkvarter.
En militärkälla uppger till nyhetsbyrån AFP att presidenten gripits och att han har ”behandlats väl”.